Tuberkulos, snabb-PCR

Mikrobiologen
  • Flera provrör kan användas

    Volym
    Tillsats
    Märkning
    Prod. nr.
    Beställs på

Remiss

Klinisk mikrobiologi / Mykobakterier(Tb).

Odling, DNA-påvisning (PCR) avseende M. tuberculosis-komplexet, och mikroskopi kan utföras på flera olika provmaterial. Mikroskopi utförs inte rutinmässigt på urin, pleuravätska, pericardvätska, likvor eller feces på grund av mycket låg känslighet.

Mängden mykobakterier varierar, varför minst två och helst sammanlagt tre prover bör tas (sputum, urin, vsk) vid minst två olika tillfällen (dagar). För sputum och vsk bör minst ett av proven vara ett morgonprov. Om sputumprov tas för snabbscreening med PCR (GeneXpert) skall alltid ytterligare prover tas för mykobakterieodling/mikroskopi pga att screening endast med PCR missar uppskattningsvis minst 30 % av tbc-fallen och inte alls detekterar icke-tuberkulösa mykobakterier.

BESTÄLLNING/ANALYSVAL

1. Vid klinisk misstanke om mykobakterieinfektion rekommenderas i normalfallet beställning av Mykobakterier odling/mikroskopi/PCR på minst två följande prov.

2. Vid behandlingsuppföljning rekommenderas Mykobakterier odling/mikroskopi och inte PCR då DNA-spår kan kvarstå flera månader efter framgångsrikt genomförd behandling. Endast odling rekommenderas också för uppföljande prov av icke-tuberkulösa mykobakterier som inte detekteras med PCR.

3. Mykobakterier odling bör väljas vid behandlingsuppföljning av tidigare bekräftad infektion av icke-tuberkulösa mykobakterier.

Provtagning

Sputum: Det bästa materialet får man på morgonen direkt när patienten vaknar, eller i samband med andningsgymnastik. Tillblandning av saliv (som innehåller massor av ointressanta bakterier) kan minimeras om patienten först tar ut eventuell protes och sköljer munnen noggrant med vatten. Patienten uppmanas att inte spotta saliv, däremot hosta upp tjockt, purulent prov från djupa luftvägarna direkt i sputumburk utan tillsats. En variant är att hosta upp i en bägare och sedan föra över det tjockaste till sputumburken. Om patienten har svårt att hosta upp, kan provet tas med hjälp av sjukgymnast.

Ibland kan man behöva provocera fram ett prov, s k inducerat sputumprov. Även då tar patienten först ut eventuell protes och sköljer munnen noggrant med vatten. Prov tas under och efter 10-20 min inandning av nebuliserad 3 % koksaltlösning.
Eftersom tuberkelbakterier utsöndras oregelbundet från lunghärdar bör prov tas under tre påföljande dagar.

Bronksköljvätska: Samla sköljvätska i skruvkorksrör eller provtagningsflaska för Tb-odling.

Ventrikelsköljvätska (VSK): Låt patienten dricka 200-300 mL kokt eller sterilt vatten, för därefter ner ventrikelsonden. Provet skall tas fastande på morgonen vid två olika tillfällen.

Provhantering

Obs! Transportera proverna i skyddshylsa. Kontrollera noga att alla skruvlock dragits åt.

Förvara och transportera provet i kyla.

Svar/Bedömning

Nyupptäckta fall telefonmeddelas. Vid utförande av snabb-PCR sker även detektion av gen för rifampicinresistens.

Prov skickas alltid även till klinisk mikrobiologi i Linköping för direktmikroskopi, PCR och odling. M. tuberculosis resistensprövas där mot isoniazid, streptomycin, etambutol och rifampicin med Bactec-teknik med resultat vanligen inom 1-2 veckor. Resistensbestämning av atypiska mykobakterier görs efter önskemål.

Faktorer som påverkar undersökningens prestanda

Feltaget prov kan medföra falskt negativt resultat.

Svarstid

Prov som är på Laboratoriemedicin, Länssjukhuset Ryhov, senast kl 13 helgfri måndag-fredag besvaras samma dag.

Direktmikroskopi och vanlig PCR besvaras vanligen inom en vecka. Odling kan ta upp till 6 veckor.

Metod

Molekylär detektion med PCR-teknik
Direktmikroskopi
Odling

Utförande laboratorium

Snabb-PCR: Molekylärbiologilaboratoriet, Länssjukhuset Ryhov, Jönköping.

Övrig diagnostik: Klinisk mikrobiologi, Universitetssjukhuset, Linköping.

Länk till "Klinisk mikrobiologi, Universitetssjukhuset, Linköping" (nytt fönster).

Länk till "Klinisk mikrobiologi, Universitetssjukhuset, Linköping" (nytt fönster).

Medicinsk bakgrund

Mykobakterier utgörs av tuberkulosbakterierna - Mycobacterium tuberculosis och M. bovis samt av de "atypiska" eller miljö-mykobakterierna såsom M. avium-intracellulare, M. chelonei, M. marinum.

Snabb-PCR beställs ffa för bedömning av smittsamhet och utförs därför endast på luftvägsprov. Traditionell diagnostik (mikroskopi, PCR och odling) innefattar även resistensbestämning och görs också alltid.